Tıp alanında her cerrahi girişim doğal olarak bir risk içerir. Ancak sanılanın aksine obezite ameliyatlarının riski diğer karın içi ameliyatlardan çok farklı değildir. Obezite ameliyatlarına bağlı ölüm riski %0.1 dir. Kanama (%2), mide kesilme hattından kaçak olması (%1-2) ve bacak damarlarında pıhtı oluşması (%0.1) prosedüre özgü diğer komplikasyonlardır. Bu komplikasyon oranlarının en aza indirilebilmesi için en önemli parametre cerrahi ekibin tecrübesidir. Unutulmamalıdır ki , Obezite ameliyatlarındaki risk, morbid obez olmanın hastaya yüklediği riske oranla çok daha düşüktür.